B細胞，即B淋巴細胞，主要執行機體的體液免疫，在抗原刺激下分泌產生抗體并發揮作用。在適應性免疫應答期間，活化的B細胞擴增并經歷其B細胞受體（BCR）的體細胞超突變，形成多樣化的細胞克隆。此外，抗體作為復合物分子，其每個重鏈（VH）和輕鏈（VL）中存在三個互補決定區（CDR），并且重鏈的CDR3變化最為豐富，可在V，D和J基因區段之間的連接處形成并且傾向于高水平的超突變。因此，B細胞產生的天然VH / VL抗體對理解抗體生物學和設計至關重要。
服務優勢
服務流程
泓迅經典案例
泓迅科技根據客戶所提供的抗體測序原始數據，通過生物信息學分析，對細胞VDJ重構、V/J基因頻率、V-J成對使用頻率、CDR3長度分析、B細胞克隆計數、受體多樣性分析、組間多樣性差異分析、組間V、J基因差異分析、組間克隆表達CDR3長度分布差異等詳細分析，并提供了專業的研究報告。
結果展示：
1） VDJ 基因使用頻率分析
Table BCR樣本中 V 基因使用頻率統計
| Gene_name | Reads | Frequency |
|---|---|---|
| 4-39*01 | 27980 | 4.97 |
| 4-34*01 | 12488 | 2.22 |
| 1-2*02 | 5007 | 0.889 |
| 3-74*01 | 4798 | 0.852 |
| 1-18*01 | 3011 | 0.535 |
| 3-7*01 | 2862 | 0.508 |
| 2-70*13 | 2313 | 0.411 |
| 3-74*03 | 2240 | 0.398 |
| 1-69*01 | 1943 | 0.345 |
| 4-31*03 | 1583 | 0.281 |
| … | … | … |
2） CDR3 區域長度分析
3） CDR3種類分析
BCR測序統計CDR3氨基酸序列長度
| CDR3 | Reads | Frequency | len |
|---|---|---|---|
| DNNNDMR | 3560 | 0.004869 | 7 |
| VISRTL | 1688 | 0.002308 | 6 |
| AVDSNYQLI | 899 | 0.001229 | 9 |
| AVNRDDKII | 718 | 0.000982 | 9 |
| AATDSWGKLQ | 696 | 0.000952 | 10 |
| AVTDSWGKLQ | 627 | 0.000857 | 10 |
| AVNTGNQFY | 595 | 0.000814 | 9 |
| AVTGGGNKLT | 573 | 0.000784 | 10 |
| AVPTGTASKLT | 562 | 0.000769 | 11 |
| LVGDTGRRALT | 540 | 0.000738 | 11 |
| AEITLT | 517 | 0.000707 | 6 |
4） 序列總長排序
BCR氨基酸序列總長reads數
| 氨基酸基因序列長度 | 氨基酸數目 | 豐度 |
|---|---|---|
| 1491 | 147 | 0.096324 |
| 20 | 139 | 0.044324 |
| 540 | 143 | 0.040395 |
| 529 | 145 | 0.041238 |
| 516 | 147 | 0.041955 |
| 504 | 143 | 0.042773 |
| 496 | 141 | 0.043976 |
| 441 | 145 | 0.040898 |
| 433 | 145 | 0.041868 |
| 387 | 148 | 0.039055 |
5） 不同樣本之間的VH基因的頻率差異分析
6） 樣本測序飽和度分析
 |
 |
7） 克隆多樣性分析
| 上機類型 | Shannon Entropy | Inverse Simpson |
|---|---|---|
| BCR | 19.7458 | 340.758 |
服務詳情
| 服務名稱 | 主要內容 | 分析軟件 | 交付周期 | 交付項目 |
|---|---|---|---|---|
| B細胞抗體測序分析服務 | 測序數據挖掘； 抗體信息分析等 |
R, Python Software等 |
7~10天 | 分析報告 |
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